虽然仙人掌是植物界里奇特种类，但它仍是植物的一种，其生命活动依然离不开水。种苗生长过程在不同季节里，对水份的要求也不相同。春旱秋冬季节因外界气温低，阳光也不强烈，只需要适量浇水就行。随着气温升高，仙人掌生长旺盛，就要充分浇水。盛夏阳光强烈，气温过高，仙人掌出现短暂休眠，此时宜节制浇水。寒冷的冬天，仙人掌进入休眠状态时，在保持苗床稍微湿润的情况下，可停止浇水。浇水要见干见湿，即一次浇透，多日不浇，如果浇水太勤，水份过多，不仅未能促进生长，还可以引起烂根，危及仙人掌生长。夏天高温期，浇水要选择在早晨和傍晚时进行。
空气湿度对食用仙人掌的生长关系密切。湿度太低，影响生长和发芽；湿度太高，易引起仙人掌及根部腐烂。仙人掌除了通过根部吸收水份和养料外，它的茎部也具有辅助功能。适宜仙人掌生长环境的空气相对湿度为60－70%。