公开在线项目吧 关注:2贴子:36
  • 3回复贴,共1

【清帆杂志】Foldit!:永久改变科研合作模式的游戏

只看楼主收藏回复

游戏化(gamification)
众包(crowdsourcing)
多人联机游戏(multi-player online game)
David Baker教授
David Baker教授是美国华盛顿大学的一位蛋白质研究科学家。他研究的生物制造主要蛋白质结构的方式(蛋白质生物合成)在原理上已经为人类所理解,此即蛋白质DNA测序的方法。


IP属地:北京1楼2015-04-30 17:18回复
    起源与发展
    在David Baker教授的研究中,想解明肽链是如何折叠成三维的蛋白质结构很困难。虽然大致的程序已经为人所知,但蛋白质结构预测还是需要大量的运算。
    最初,他和实验室的同事开发了一个叫Rosetta的程序,来预测不同蛋白质的自然结构。但是复杂的计算吃掉大量的计算机资源,很快实验室的设备就不能满足。这时,他们想到利用个人计算机的资源,开发了一个Rosetta@home的项目,在计算机不用的时候作为一个屏幕保护程序来运行。但是志愿提供个人电脑的人却有些不爽,因为他们能做的只能是盯着屏保,而完全无法参与到研究的过程中。
    为了用户能够更好地参与,David和他的合作伙伴,计算机系的教授David Salesin和Zoran Popović,以及游戏设计专家Seth Cooper,几位牛人一起共同开发了一个参与度更高的程序:Foldit! 它是一个蛋白质折叠电子游戏,却永久的改变了科研合作的模式。
    Foldit提供一系列教程,让用户试着操纵简单的类蛋白质构造,并定期更新以真实蛋白质结构为基础的谜题。该程序让用户在工具辅助解谜,就能够得出实际的蛋白质模型。每当结构被变动,一个“分数”会根据折叠的完善程度给出。Foldit用户可以创立加入小组,分享各自的方案。也有小组高分榜。


    IP属地:北京2楼2015-04-30 17:18
    回复
      2025-07-23 08:53:31
      广告
      不感兴趣
      开通SVIP免广告
      Foldit尝试利用人脑天生的三维图形匹配能力。目前该程序出的谜题都是基于已被人们清楚了解的蛋白质;通过分析人类在解这些谜题时的直觉思考途径,研究者希望能改进现有蛋白质折叠软件所用的算法。
      科学家们一直研究爱滋病的逆转录酶,已有十五年之久,这种蛋白质酶是爱滋病毒在活体细胞中复制和繁殖自己的重要关键,但在游戏中逆转录酶的结构在十天内被玩家们破解。


      IP属地:北京3楼2015-04-30 17:18
      回复
        累累硕果
        如今,Foldit!的已经硕果累累,从2010年起,在《Nature》、《Science》上发表了多篇重磅文章。与其成果相比,Foldit!的方法论更加让人津津乐道。


        IP属地:北京4楼2015-04-30 17:19
        回复