首先要提出一个比较重要的理念：
水中的毒素是养鱼出现问题的万恶之首，万恶之源。
水中的毒素一般是指氨和亚硝酸盐，属于剧毒，可以造成鱼的急性死亡或者慢性中毒。
慢性中毒破坏机体组织的免疫系统，降低抵抗力，鱼是病从鳃入，总得病的鱼和长期在毒水中饲养有很大关系。因此这两项毒素指标必须越低越好最好是0。
为何要如此重视硝化菌，原因就在此。

关于 氨
氨的产生途径：1、鱼的呼吸2、鱼的尿液3、有机物被异营菌分解后的代谢产物（鱼的粪便、残饵、死鱼等）
什么是异营菌、自营菌
异营菌（肠杆菌、芽孢杆菌、弧菌、乳酸菌、粪链球菌等）这些细菌有的是正常的肠道菌属，无害。
有的却是病源微生物，可引发各种疾病，比如说大肠杆菌、弧菌。因此很容易污染水质，所以缸底有鱼便残留的鱼缸水质不好就是这个道理。
异营菌包括腐生菌和寄生菌两类。腐生菌以无生命的有机物质作为营养物质；寄生菌寄生于活的动植物，从宿主体内的有机物质中获得营养。所有致病菌都是异营菌。
异营菌的来源：1、鱼体自带及粪便，2、空气中的袍子，3、食物以及进入鱼缸的任何物品，4、水源

氨的危害：
氨对鱼类的毒害反映非常强，是亚硝酸盐的十倍，在浓度很低的水体中，就可以使许多鱼类产生中毒症状，甚至死亡。氨对鱼类的毒害情形根据浓度和鱼类的不同而不同。
在0.01-0.02ppm的浓度下：
鱼类可以忍受一段时间，但长期下去也会慢性中毒会干预鱼类渗透调节系统，破坏鱼鳃的粘膜层，减低血红素携带氧气能力。鱼类症状表现有，如常在水面喘气，鳃转为紫色或暗红，比较容易瞌睡，食欲不振，老停留在缸底不活动鱼鳍或体表出现异常血丝等。
在0.02-0.05ppm浓度下：
氨会和其他疾病加速鱼类死亡。
在0.05-0.2ppm浓度下：
会直接破会鱼类皮肤和肠道粘膜，照常体表和内部器官出血，同时伤害大脑和中枢神经系统。0.05-0.2ppm为致死浓度，鱼类会急性中毒迅速死亡。
致死浓度指的是最低致死计量，因鱼种不同而异。
氨的中毒机理：毒素通过鱼的呼吸作用，由鳃丝进入血液，把血红蛋白氧化成高价血红蛋白，使其丧失输氧能力，出现组织缺氧，窒息而死。
氨中毒的症状：
鱼出现窜游现象、并时而出现下沉、侧卧、痉挛等症状。
呼吸急促，大口挣扎，死前眼球突出。
鳃盖部分张开，鳃丝呈紫红色或紫黑色。
鱼鳍舒展，根基出血。
体色变浅，体表粘液增多。
打开腹腔，血液不凝、血色发暗、紫而不红，肝脾肾的颜色呈紫色。
氨的存在形式：
水中的氨有两种不同的形式，一种是氨（NH3）,另一种是铵（NH4+）。氨有剧毒，铵无毒。一般氨测试剂所测试的是氨和铵的总浓度，有时候测试出总浓度非常高，但鱼却很健康，水中铵的比例大。酸跌后可以检测到氨就是这个道理。
氨与铵在水中是根据PH来互相转化的，PH越高，水中所含有毒的氨（NH3）的百分比也越高。例如PH=9时，水中有25%的总氨是有毒的氨（NH3）；PH=7时有毒氨的含量只占总氨的1%。在酸性水中，有毒的氨（NH3）基本不存在。所以氨的毒性会因PH升高而增加。

氨的控制：
氨对鱼类具有强烈的毒性，只有把氨控制在极低的浓度下，才不会影响鱼的健康，控制氨的浓度可以采用以下几个方法：
换水降低氨的浓度，这是短期快速降氨方法，并不能根本解决问题。
把水的PH调整到弱酸性，也就是PH<7的状态下，水中有剧毒的氨会转化成无毒的铵。但这种方法也不能根本解决问题，存在非常大的潜在威胁。和换水一样只可作为短期快速降氨方法。
可以大量种植水草，水草能以吸收铵的方式来间接消费氨，铵可以作为一种氮肥成为水草的养分。在一定的PH以及温度下，水中的氨和铵会有一定比率的转化关系，铵减少时，部分氨就会自动转化为铵，氨也就减少了。水草对铵的吸收可以降低氨的浓度，在水草茂盛的鱼缸中，氨的威胁也就非常小了，是根本控制氨的方法之一。
建立完善的硝化系统，培养大量的硝化细菌（自营性细菌中去除氨的主力细菌），这种方法也是生态平衡体系中的一环，自营性细菌会直接吃氨，最终转化出无毒的硝酸盐。只要能培养住够多的硝化菌来转化氨，氨的浓度就能长期稳定的保持在非常底的安全浓度范围内，这也是在没有大量种植水草的鱼缸中普遍采用的方法。

忘记说了 所有理论都转自 森林大帝

深度解析一下硝化菌
在自然界中共同执行硝化作用的硝化细菌共有两类：
第一类是亚硝酸菌，它能在有氧的条件下，以氨为食物，把氨转化成亚硝酸盐，从中得到能量。
亚硝酸菌：亚硝化单胞菌属、亚硝化球菌属、亚硝化螺菌属和亚硝化叶菌属中的细菌。
第二类是硝酸菌，他能在类似的条件下，将亚硝酸盐转化为硝酸盐。
硝酸菌：硝化杆菌属、硝化球菌属和硝化囊菌属中的细菌。
所以硝化菌不是单指的一种菌，而是两大类，里面包含各种各样的菌。

硝化菌的形态：
大多数在水中的硝化细菌具有能游泳的鞭毛，其长度为菌体细胞的数倍，使菌体能在水中游动。
有人说添加硝化菌的时候一定要倒在滤材上，有必要吗？
答案没必要，硝化菌在水中被激活后可以自己运动，找到合适的地方吸附在上面，所以硝化菌没必要一定倒在滤材上。

硝化细菌的附着性：
漂流中的硝化细菌是不能进行硝化作用的，必须附着在固体表面。硝化菌会分泌出一种粘性物质，把自己给粘在固体表面上。随着硝化菌的繁衍，数量不断增加，一团一团硝化菌彼此粘在一起，形成了一层生物膜，包在固体的表面上。
这个特性告诉我们：uv紫外线杀菌灯对硝化系统的破坏几乎可以忽略不计，因为有用的硝化菌都在滤材上，uv灯杀掉的多数是水里的异营菌，所以大家不要担心使用uv灯会破坏硝化系统。
生物膜有保护作用，Powell SJ等在1992曾做实验，把消毒药分别放入一瓶住在生物膜的菌，及另一瓶浮游的菌。结果是住在生物膜的菌没有事，浮游的死了82%。
这个试验告诉我们：硝化菌不是那么脆弱，生物膜是一道屏障。
使用二氧化氯进行鱼病的治疗和防疫，0.5ppm的二氧化氯对99%的细菌病毒具有杀灭作用，但却不会破坏硝化系统，这要归功于硝化菌生物膜的保护作用。
依据硝化细菌的附着性，表面积大的滤材能生长更多的硝化细菌。判断滤材表面积的大小方法很简单就一条：同种滤材体积越小、表面越粗糙的，表面积越大。所以龙鱼常用的细菌屋其实是表面积最小的滤材，浪费了底滤槽的空间。

硝化细菌需要的营养物质：
硝化细菌是自营性细菌，主食是氨，同时也必须要吸收无机物营养物质，例如，铁，锰，磷，钾，钙，镁等无机离子，用于代谢合成许多硝化菌生长所需的化合物。我们可以通过换水来补偿这些物质。
不能完全用纯净水养鱼：缺少无机物营养物质对硝化菌和鱼都是不利的，所以要兑自来水。

硝化细菌的生长速度：
一个异营菌繁殖周期平均约为22分钟，就是22分钟后1个变2个，然后在翻倍成4个，理论上说在20个小时后，1个细菌可以变成1亿个，可见异营菌繁殖的速度惊人。
而硝化细菌就逊色很多，亚硝酸菌繁殖周期大约是24—36小时，也就是说20小时后亚硝酸菌还停留在1个细菌的状态。而硝酸菌繁殖周期更长，平均要花掉60个小时才能增值1倍，这也是造成新缸综合症的主要原因。
新缸综合症：在开缸1周至一个月这个期间内，由于硝化菌的生长速度过慢，不能完全分解掉水中的毒素，而造成鱼类中毒死亡的现象叫做新缸综合症。
硝化细菌的生长速度告诉我们，开缸养水必须是需要时间的。如果你有水质毒素检测试剂的话，可以依据检测的结果，氨和亚硝酸盐全部为零作为开缸合格的标准。如果没有水质毒素检测试剂依据经验的话，30-45天硝化系统才会成熟。凡是说开缸3-5天硝化菌就培养好了可以下主鱼的，都是忽悠人的，没有任何科学依据，如果这时候下鱼，新缸综合症会等着你。

硝化菌与盐的关系
硝化菌对盐所产生的渗透压有很强的忍受力，所以硝化菌不怕盐！我们鱼缸里下千分之5的盐对硝化菌没有什么影响，说盐可以杀硝化菌那是谬论。

硝化菌与光照的关系
硝化菌不适应日光直接照射，也不太适应室内的灯光，尤其是不适应蓝光和紫外光。鱼缸内壁和器材表面虽然可以附着硝化菌，但是因为光照的原因，并不适合硝化菌的生长。成品缸的滤槽大部分都是黑色塑料的，也是考虑到光照的原因。

硝化菌与氨的关系
氨和亚硝酸作为硝化细菌的食物不可缺少，并不是越多越好。
如果氨浓度高于10ppm，可能会对亚硝酸菌产生抑制作用，高于0.1-1.0ppm对硝酸菌产生抑制作用。
亚硝酸盐浓度大于0.22-2.8ppm，会抑制硝酸菌作用。
科学开缸养菌的真谛是：“合理平衡的氨的供给，硝化菌才能更好的生存”。不要用死鱼死虾来开缸，那样会产生大量的毒素，反而抑制了硝化菌的生长，适得其反了。

硝化菌与温度的关系
硝化菌的最佳生长温度是25-30度，当温度低于18度时硝化菌生长速度减半，低于10度时硝化菌停止活动，低于4度时硝化菌停止生长，0度死亡。高于42度则进入生命高危区。硝化菌制剂不能冷冻，一般也不需要冷藏。