首先来看查克拉，扉间五遁俱全，水门则只掌握三遁，但水门会使用仙术查克拉（据他自己说使用不熟练）
因此综合来看，二人对查克拉的掌握情况比分差不多。扉间更全面一点。

忍术方面，水门招牌忍术有，飞雷神及其系列忍术（飞雷神导雷，飞雷神二段等），螺旋丸，通灵术，封印术（尸鬼封尽，四赤阳阵等）
扉间招牌忍术有，飞雷神及其系列忍术（飞雷神斩，飞雷神二段等），水遁系列忍术（水龙卷，水冲波等），各种禁术（多重影分身，秽土转生，互乘起爆符等），封印术（四赤阳阵等），幻术黑暗行

先对比飞雷神，二代钦定水门的瞬身更快，但这里瞬身是否指的是飞雷神存疑（姑且算是吧。）
因此速度方面
水门＞扉间

攻击型忍术方面，水门以苦无、螺旋丸辅助飞雷神作为主要攻击手段。
扉间则是使用水遁忍术和飞雷神斩作为主要攻击手段。

生前战绩方面，排除一些小杂兵
水门：
正面对战AB兄弟，平
被虎皮带土先手偷袭，略胜，放跑带土。
后于九尾战斗，和玖辛奈合力封印九尾后，水门死亡。
扉间：
正面对战宇智波泉奈，胜。将泉奈重创
被金银角兄弟偷袭，逃出后，主动拦截金银角+一众叛忍，败，死亡。
战绩方面，水门略强于扉间。
虽然水门两场都没有完胜，但是对战的对手实力应大于泉奈，金银角+叛忍众。
因为金银角兄弟身怀九尾查克拉和六道忍具，容易机制杀，且偷袭在先，所以水门战绩强的有限。
。

实战素质方面（战斗智商，反应力，判断力）
战斗智商，水门≈扉间
参考：水门绕后奇拉比，扉间借水雾瞬斩泉奈
双方都属于先迷惑对手，然后一击得手类型。
反应力，判断力：扉间＞水门
参考：
扉间看见水门，直接开发飞雷神瞬回互传之术
扉间看见蛤蟆吐痰，马上反应过来和鸣人联动打伤带土。
面对跟过来的求道玉，水门反应是，来不及了，只能肉身带走。扉间则反应更快，直接把爆炸还了回去
这几次水门扉间都在场，但扉间始终判定和反应快一拍。
因此，综合来看战斗素质
扉间＞水门。