｜病毒中的“巨无霸”
一提到病毒，人们通常会把它们同阴险狡诈的入侵者联系起来，这些小东西通过巧妙的方式骗过免疫系统，潜入细胞内部，劫持物资来复制自身。病毒不具有细胞结构，不能独立生活，必须严格寄生于宿主细胞内才能展现它们那抽象外表下蕴藏的恐怖活力。
但核质病毒的发现，彻底改变了人们对于病毒的刻板印象，它模糊了病毒与细胞的界限。它们体型巨大（直径可达500nm），有的类群在普通光学显微镜下便可窥见，以至于刚开始研究者们误以为它们是某种细菌；同时它们也具有着巨大的基因组（可达1.2 Mb），编码着数不胜数的“作案工具”，远远赛过了一些CPR细菌和DPANN古菌；它们有的类群甚至掌握着不完全三羧酸循环的“独家秘籍”，要知道，这可是细胞生物才有的“卡脖子技术”啊！
那么今天就让我们一起走进核质病毒，去探索这个进化过程中诞生的神秘而诡谲的类群。

下图直观感受它们的巨大 顺便放一张该域的演化树

｜会办“工厂”的病毒？
不同于常规病毒，某些核质病毒的遗传物质并不直接侵入宿主细胞核，而是直接将宿主的细胞质改造，形成一个被称为“病毒工厂”（VF）的结构。
病毒工厂的核心要素是复制细胞器（RO），病毒复制复合体（VRC）在那里复制病毒基因组的多个副本。在许多情况下，工厂由重塑的质膜构成，包含在病毒复制、组装和释放中具有特定作用的功能区段。
其他细胞组分如线粒体，高尔基体和细胞骨架通常被招募到病毒工厂，并与RO接触。但是研究者们还并未完全弄清楚这种行为的具体意义。
VF直径可达几微米，占据大细胞内区域，并导致宿主细胞核的降解（俗称“被夺舍了”）。
核质病毒的VF并非一成不变，必要时它们也会做适当的“拆迁”。VF时刻保持着与细胞内运输路径的通信，以整合必要成分并促进新形成的病毒颗粒的排出此外，随着病毒生命特定步骤所需特定物质的变化，VF也会跟着改变。
图二 三维扫描的VFs

｜悬置类群-Mriyaviricetes 梦境病毒纲
（好浪漫的名字）
下属只有一属一种，命名为雅拉病毒Yaravirus，名字来源于对当地图-瓜土著部落神话中的水神雅拉的致敬。
如图为2020年在巴西的一个人工湖中分离出来一种雅拉病毒。
a:负染色显示被感染的变形虫中存在二十面体病毒颗粒，这正是雅拉病毒。
b:纯化粒子的透射电子显微镜图像显示了雅拉病毒颗粒呈现两个衣壳。在感染初期，发现其附着在变形虫质膜外侧。
c:个别雅拉病毒颗粒被纳入内吞囊泡内
d:指出阿米巴虫对病毒的摄取可以是单个颗粒，也可以是多个颗粒一起，如在显微照片中观察到的那样
e:显示病毒工厂完全发育，占据了核区域，并将线粒体招募到其周围。这里可以区分出两个不同的区域：一个是电子透明区域，病毒颗粒在此处组装成空壳；另一个区域由多个电子致密点组成，病毒基因组在此处被包装进颗粒中，
有趣的是，它们具有约90%的未知序列（与已知所有生物不同源），不过很遗憾，由于资金问题，后续研究不了了之。

丨存疑类群 奇病毒
奇病毒纲（门）2023年，一个宏基因组分析发现了一个在海洋真光层感染浮游生物的新属（未合格发表）奇病毒Mirusvirus，意为惊奇的，惊讶的。
但这货貌似域还未定，有的说是双链病毒域的，有的说是多变病毒域的，论文的演化树貌似支持它们是核质病毒的姐妹群（？）。
在一百四十三个站点中，有一百三十一个站点监测到了奇病毒，包括从北极到南极，它们主要出现在0.2～5微米（占76.3%）和3～20微米的组分呈现高度多样性。它们被分为七个亚种族。更有趣的是，研究团队在排除是人为杂交的可能性后，发现根据其病毒模块，它属于双链病毒域，但其标志性信息基因却在核质病毒里普遍存在同源物。
如图 奇病毒的系统发育位置

丨嗜血狂魔 非洲猪瘟病毒目
痘病毒纲
非洲猪瘟病毒目 一属
出血非洲猪瘟病毒Asfivirus haemorrhagiae
其分离物的线性双链DNA基因组为170-194 kbp 病毒有一个内部核心、一个内部脂质层、一个二十面体衣壳和一个外部脂质包膜。
家猪和野猪的感染会导致非洲猪瘟，十分恐怖 死亡率可高达百分之百 被感染的猪会出现高烧不退 全身出血 皮肤紫斑等现象 目前尚无特效药物治疗和疫苗接种可用。在猪粪里能存活是一天 冻猪肉里能存活一千天 对于毒感染可以通过接触、摄入或通过Ornithodoros属的蜱虫传播。这种病毒在非洲流行，那里的疣猪和灌木猪充当蓄水池。该病毒从西非传播到伊比利亚半岛，30年来一直流行，最终在意大利撒丁岛以外的欧洲被根除。2007年，病毒再次从非洲通过高加索传播到欧洲，目前正在俄罗斯联邦和波罗的海共和国、波兰、捷克共和国和罗马尼亚等几个邻国爆发疫情
它们由一个直径为70-100纳米的核蛋白核心结构组成，周围环绕着一个内部脂质层和一个直径为170-190纳米的二十面体衣壳，最终被一个含有脂质的外包膜包围。这个外包膜是感染的。衣壳体表现出二十面体对称性（T=189-217），对应于1892-2172衣壳体。每个内壳体的直径为13纳米，内壳体之间的距离为7.4-8.1纳米。内膜环绕着覆盖含有核酸的核心外壳。细胞外包膜病毒的直径为175-215纳米
图一 非洲猪瘟病毒 图二 它的传播途径

非洲猪瘟病毒的流行病史
非洲猪瘟病毒在世界范围内的流行已途百年。1921年,病毒学家Montgomery首次报道了肯尼亚非瘟疫情,自此该病在撒哈拉沙漠以南的非洲国家广泛流行。
20世纪50年代后期, 非洲猪瘟病毒传入欧洲,南美和加勒比海周边的国家。得力于严格的生物安全控制和扑杀措施,很多国家和地区于20世纪90年代中期有效控制或根除了非洲猪瘟。
2007年左右,基因II型非洲猪瘟病毒传入高加索地区的格鲁吉亚,亚美尼亚和俄罗斯,此后10年间,非洲猪瘟扩散至欧洲东部和中 部,俄罗斯中部及远东地区
自2018年8月,我国暴发首例由基因型II非洲猪瘟毒株引起的非瘟疫情,并迅速扩散至除台湾之外的所有省、市、自治区,重创生猪产业。疫情还波及周边国家和地区,包括韩国、越 南、蒙古、束埔寨、朝鲜和缅甸等,整个东亚地区非瘟风险持续攀升。
自2018年传入我国后,非洲猪瘟病毒在我国的流行大致经历了4个阶段：
（1)2018-2019年以基因II型强毒株的流行为主,感染猪致死率可达100%。
（2)此后基因缺失毒株在田间出现,遗传多样性逐步增加,该类毒株毒力减弱,可引起慢性感染或无症状感染,感染性强,排毒不规律
（3)至2021年左右,基因I型毒株在田间出现,并与基因II型毒株发生混合感染
（4)其后出现I/II型重组毒株,进一步加剧了我国非洲猪瘟毒株的多样性和复杂性。

接下来Chitovirales一科痘病毒科Poxviridae俩亚科
先介绍昆虫痘病毒亚科Entomopoxvirinae
甲昆虫痘病毒属 Alphaentomopoxvirus
感染甲虫的痘病毒 全球已经发现七种 感染该疾病的昆虫会引起若虫阶段的白化和松弛
该病毒颗粒是卵圆形的，大小约为400-450×220-250纳米，有一个侧体和一个单侧凹核。表面球状单位使病毒具有桑葚状的外观，直径为22纳米。
唯一可用的完整基因组序列是Anomala cuprea entomopoxvirus（ACEV）。dsDNA基因组约为246 kbp，编码约241个独特的功能基因；G + C含量为20%。颠倒末端重复序列（ITR）约为23 kbp，比通常报告的脊髓状病毒要大得多。这些基因组特征是否代表该属目前尚不清楚。ACEV基因组包括49个被认为在痘病毒科中保存的基因，但它们的顺序与脊髓痘病毒的顺序不相等（Mitsuhashi等人，2014年）。在241个假定基因中，152个似乎是其他昆虫痘病毒基因的正交基因。ACEV和贝塔昆虫痘病毒属成员之间共享的同源基因数量似乎比ACEV和德尔塔昆虫痘病毒属的单一成员之间共享的同源基因数量更多。对球蛋白基因的系统发育分析也支持了这种更密切的关系。
如图可见该病毒侧体

好贴！顶！
大佬是把所有科都讲完不？

贝塔昆虫痘病毒属Betaentomopoxvirus
它们感染鳞翅目昆虫 会导致宿主细胞细胞骨架重组 幼虫蜕皮停止 幼虫瘫痪 失去协调和嗜睡。该属包括十六个物种，在宿主的细胞解体后 成熟的病毒颗粒会被困在里面 而被认为是对感染有帮助的 整体成卵圆形或形似砖块 体型大约225–275 × 320–375 纳米大小 拥有圆柱形的核和袖子状的两个侧体 同样的桑葚状结构 一个直径约为四十纳米

感觉这个亚科结构差异不太大🤔后面还有两个属不过多介绍
德尔塔昆虫痘病毒属Deltaentomopoxvirus
感染北美洲迁徙的蚂蚱以及其他直翅目昆虫 脂肪组织是它们主要的攻击目标 疾病发展缓慢 机体全身衰弱导致高死亡率 属内只有一种
嘎玛昆虫痘病毒Gammaentomopoxvirus
包括六个物种，其成员感染双翅目。疾病迹象包括角质层下白色斑块的积累和第四阶段幼虫的液化。

好文怒顶

脊索痘病毒亚科Chordopoxvirinae
该亚科只感染脊椎动物 其线形双链dna基因组含量为128-360kbp G+C含量约为25%-67% 远超昆虫亚科 症状普遍为弥漫性皮疹 皮肤局部病变和皮肤结节
潜伏期可在一到三周 四到六周进展或者解决 死亡率可能很高 往往一次病好了会对以后的感染具有强大的免疫力

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